Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE2Q5VT97 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms