Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms