Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF5Q5TYX0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms