Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms