Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 491.7 ms