Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM240Q5SV17 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms