Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPANXN3Q5MJ09 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPANXN3Q5MJ09 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPANXN3Q5MJ09 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms