Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HABP4Q5JVS0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HABP4Q5JVS0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 392.3 ms