Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMPD3Q5JV73 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms