Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM61Q5EBN2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM61Q5EBN2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM61Q5EBN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms