Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF542PQ5EBM4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms