Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC12

MSS51, Putative protein MSS51 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSS51Q4VC12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSS51Q4VC12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSS51Q4VC12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms