Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf21Q32NC0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms