Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A9Q2M3M2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A9Q2M3M2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms