Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMPG1Q17R60 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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