Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA3Q16787 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA3Q16787 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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