Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCSK7Q16549 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK7Q16549 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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