Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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RAB11BQ15907 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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RAB11BQ15907 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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RAB11BQ15907 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RAB11BQ15907 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RAB11BQ15907 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB11BQ15907 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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