Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRADDQ15628 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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