Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF11Q15544 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF11Q15544 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF11Q15544 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms