Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH1Q15438 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms