Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTF1Q15361 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTF1Q15361 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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