Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRKQ15262 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRKQ15262 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
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