Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRRQ15256 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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