Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD6Q15008 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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