Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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