Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BECN1Q14457 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BECN1Q14457 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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