Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNQ14247 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNQ14247 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNQ14247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms