Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM53BQ14153 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM53BQ14153 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM53BQ14153 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM53BQ14153 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM53BQ14153 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM53BQ14153 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms