Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4AQ14139 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4AQ14139 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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