Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC3Q14003 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNC3Q14003 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC3Q14003 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms