Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAPGEF1Q13905 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEF1Q13905 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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