Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX39BQ13838 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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