Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALCAMQ13740 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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