Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1SQ13698 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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