Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX1Q13596 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX1Q13596 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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