Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF5Q13568 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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