Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NAE1Q13564 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAE1Q13564 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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