Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEUROD1Q13562 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEUROD1Q13562 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
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