Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB3Q13509 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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