Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCIRG1Q13488 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCIRG1Q13488 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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