Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAF1AQ13111 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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