Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRDNQ13061 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
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