Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PRDM2Q13029 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PRDM2Q13029 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
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