Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FOXD4Q12950 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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