Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH17Q12864 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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