Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPTFQ12830 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPTFQ12830 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
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