Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFEMP1Q12805 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFEMP1Q12805 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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