Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC15Q0P6D6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC15Q0P6D6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms