Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD300CQ08708 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms